Flujo marron en ultimo dia de regla :s que es?

hola.. tengo un pequeño problema, mi novio y yo tenemos relaciones sexuales y me cuidaba con pastillas pero las deje de tomar un mes, hace algunos dias tuvimos relaciones y nos protejimos con preservativos eso fue dias antes de mi regla.. cuando me empezo la regla empece a tomar las anticonceptivas nuevamente pero en el ultimo dia de periodo (dia 4) el sangrado fue marron oscuro.. no se si sera efecto de las pastillas o pueda ser otra cosa, porque he leido que cuando te embarazas tienes un flujo marron.. alguien sabee??